Protisti e batteri appartengono a domini diversi della vita, eucarioti e procarioti, divise da lunghi secoli di evoluzione. Comunque, come tutte le forme di vita sulla terra, essi condividono un antenato comune, e quindi ci sono un numero di somiglianze intriganti. Nonostante l'incredibile diversità di protisti e di batteri, è possibile effettuare alcune generalizzazioni circa che cosa hanno in comune.
Codice genetico
Nei protisti, batteri e tutti gli altri organismi, determinate sequenze di coppie di basi chimiche nel DNA codice per alcuni aminoacidi. Il codice è quasi universale, nel senso che la stessa sequenza dal DNA codificherà per la stessa sequenza di amminoacidi in un batterio e un protista. Le eccezioni a questa universalità includono il fatto che alcuni batteri usano la sequenza UAG al codice per Pirrolisina anziché un codone di arresto, che è come è usato in altri organismi. Tuttavia, per la maggior parte, il codice è una notevole somiglianza tra batteri e protisti.
Ribosomi
Sia batteri e protisti prima trascrivono sezioni del loro codice DNA in RNA, quindi traducono questo RNA in proteine utilizzando strutture complesse chiamate ribosomi. Ancora una volta, protisti e batteri condividono queste somiglianze con tutte le altre forme di vita. La struttura del ribosoma differisce da piuttosto tra batteri ed eucarioti come i protisti. Questa differenza è importante, troppo, perché alcuni antibiotici uccidono i batteri facendo uso delle differenze tra i ribosomi batterici ed eucariotici.
Membrane cellulari
Sia batteri e protisti hanno fatta di sostanze chimiche chiamate fosfolipidi delle membrane cellulari. Un fosfolipide in un batterio o un protista ha un gruppo solubile in acqua ad una estremità e una coda di insolubile in acqua a altra, così le membrane cellulari dei batteri e protisti sono costruite da un doppio strato di fosfolipidi. Le code sia punto verso il centro del bilayer. I batteri hanno una parete cellulare, oltre alla loro membrana delle cellule, tuttavia, e alcuni batteri hanno sia una membrana interna ed esterna.
Processi altamente conservati
Batteri e protisti condividono somiglianze nei vari processi biochimici che sono anche molto simili a quelli di tutte le altre forme di vita. Il processo che batteri e protisti utilizzano per abbattere il glucosio viene chiamato glicolisi. Anche se ci sono alcune variazioni, glicolisi avviene in quasi tutti gli organismi noti. Allo stesso modo, il processo di replicazione del DNA è molto simile tra batteri e protisti con alcune piccole differenze.