Agar è una sostanza gelatinosa derivati da alghe e usato come substrato per la coltivazione di specie bersaglio di microbi, funghi, cellule o piccole piante. Un brodo nutritivo, d'altra parte, è un substrato liquido utilizzato per lo stesso scopo. Questi mezzi di crescita possono essere infettati facilmente dai microbi opportunisti che sfruttano le sostanze nutrienti disponibili facilmente. Nonostante il miglior protocollo di sterilizzazione di laboratorio, la contaminazione può comunque verificarsi.
Polvere
In gran parte invisibile e onnipresente, la polvere è una causa comune di contaminazione nelle piastre di agar nutriente. Microbi ambientali nel laboratorio colonizzare le particelle di polvere nell'aria possono stabilirsi sulle piastre di agar scoperti durante il raffreddamento o inoculazione. Il più a lungo l'esposizione dei substrati di coltivazione di superficie all'aria, maggiore sarà il rischio di contaminazione da microrganismi nell'aria.
Povero sterilizzazione
Sterilizzare gli strumenti di inoculazione accuratamente in autoclave dopo ogni utilizzo. Non riuscendo a farlo può trasferire i microbi da una cultura a altra, rovinando la cultura. È anche possibile utilizzare gli strumenti monouso inoculazione invece per evitare la necessità per la sterilizzazione. In entrambi i casi, è necessario mantenere gli strumenti nel confezionamento asettico tra vaccinazioni.
Contaminazione umana
Mentre si lavora in laboratorio, i ricercatori possono contaminare le loro culture. Tecnici di laboratorio devono prendere cura di tenere tutte le superfici esposte del corpo---in particolare le mani---coperte quando la manipolazione dei media di crescita. Cambiare i guanti monouso ogni volta che fanno contatto con una superficie non sterile e ogni volta che si cominciano a preparare una nuova cultura. Preparare culture all'interno di una cappa aspirante generando positivo flusso d'aria per evitare contaminazione dispersa nell'aria dalla respirazione di tecnico di laboratorio.
Conservazione impropria
La maggiore causa di contaminazione nei media di crescita è conservazione impropria. La cattiva gestione delle culture mentre in incubazione possono contaminarli direttamente o semplicemente disturbare loro protettivo che copre, permettendo l'ambientali opportunistici microbi accesso al substrato. L'unico modo per evitare questo tipo di contaminazione implica la gestione adeguata vigilanza durante la manipolazione di colture e astenendosi dal loro manipolazione più del necessario.