Nel 2009, la United States Department of Agriculture (USDA) elencati 47 piante in via d'estinzione e 5 piante minacciate in Puerto Rico. Piantagioni di caffè e canna da zucchero coloniale disboscate 90 per cento della foresta nativa di Puerto Rico e disturbato la foresta restante. Solo 0,2 per cento di vecchia crescita rimane. Gli Stati Uniti ha acquisito Puerto Rico nel 1898. Nel 1907, la foresta nazionale caraibica è stata stabilita sulla terra ex corona spagnola. Esempi di conservazione nell'ambito dell'Endangered Species Act sono descritti di seguito.
Arbusto
Peperomia wheeleri è un arbusto sempreverde alto 3 piedi che cresce a circa 600 piedi di altitudine in foreste secche subtropicali su Monte Resaca in Culebra National Wildlife Refuge. I sopravvissuti diverse centinaia crescono nell'humus profondo sul pavimento della foresta. Rimozione di alberi eliminerebbe il loro habitat. Conservazione comprende preservare la foresta e impediscono di raggiungere le piante restanti pollame (polli) e bestiame. Esemplari in Fairchild Tropical Garden, Miami, prodotto i semi con un tasso di germinazione del 10 per cento. Propagazione con talee è più successo.
Felce
Thelypteris inabonensis è una bella felce con lame 22 pollici di altezza. I 46 sopravvissuti sono minacciati dalla loro popolazione limitata, pratiche di gestione forestale, esposizione a condizioni di uragano e potenziale raccolta dai giardinieri. T. inabonensis si trova presso due sedi bagnato montane palm sierra si trova nella foresta di Toro Negro del Commonwealth. Nessuna collezione è consentita, ma i siti sono remote e difficili da controllare. Altre due specie di Puerto Rican Thelypteris sono in pericolo: 25 T. verecunda sono trovata su un terreno privato a tre posizioni e 63 T. yaucoensis sono a 3 posizioni.
Albero
Juglans jamaicensis (giamaicano noce), un grande albero raro, si trova sull'isola di Hispaniola, Cuba e Puerto Rico. L'albero è stato nominato in errore in Europa da disegni e non è mai cresciuto in Giamaica. Gli esemplari di Puerto Rican sopravvivono ad una sede su un terreno privato, minacciata da clear-cuts per l'agricoltura. Distribuzione pre-coloniale era abbastanza grande per la raccolta di legname. Dopo il 1915, Juglans jamaicensis è ritenuto estinto fino al 1974, quando furono scoperti i 14 individui ai 3.500 piedi, tra piantagioni di caffè. I restanti individui sono protetti.
Orchidea
Lepanthes eltoroensis è una minuscola orchidea che sopravvive a cinque posizioni sul picco di El Toro nella foresta nazionale caraibica. L. eltoroensis è minacciata da uragani, la raccolta e la gestione di foresta che include piantagione, manutenzione selettiva di taglio e trail. La 360 conosciuto individui crescere due pollici di altezza sui tronchi di albero muscoso ad altitudini elevate nelle montagne di Luquillo. La riproduzione è successo il 30 per cento perché semi mancano un endosperma (conservazione degli alimenti) e devono essere soffiati a contatto con un fungo specifico per germinare. Habitat e gli individui sono protetti.
Erba
Aristida portoricensis (pelos del Diablo, capelli del diavolo) è un'erba perenne, sopravvivendo alle due posizioni su piste con terreni di argilla rossa e roccia serpentina. Piantati per il pascolo erbe eliminato areale passato, ma suoli che si sviluppano su serpentine sono tossici per molte piante. Aristida portoricensis è tra crescita lenta piante adattate ad esso. A. portoricensis cresce fino a 4 pollici di altezza in fessure rocciose. Sviluppo residenziale ridotto una posizione rimanente, e operazioni minerarie minacciano l'altro. Habitat e piante sono ora protetti.