Sulla base del gameplay delle due puntate precedenti, "Mortal Kombat 3" introduce una serie di nuove funzionalità per il popolare gioco di combattimento. Tuttavia, molte di queste caratteristiche non sono prontamente disponibili per i giocatori, perché sono stati nascosti dagli sviluppatori del gioco. Per accedere alle funzionalità di gioco speciali e sbloccare personaggi giocabili come il mortale cyborg chiamato fumo, è in primo luogo bisogno di attivare i menu opzioni nascoste inserendo le specifiche combinazioni di tasti nella schermata del menu principale.
Codici di killer
Nel menu principale, premere "C", "Right", "A," "Sinistra", "A", "Up", "C" "Giusto," "A," "Sinistra", "A" "Up" sul primo controller di giocatore. Dove si può abilitare fumo come personaggio giocabile, attivare rapide mosse finali e abilitare boss come personaggi giocabili, viene visualizzato il menu di "Codici di Killer". C'è anche un'opzione per giocare il gioco nascosto - uno sparatutto retrò Galaxian.
Cheat Menu
Nel menu principale, premere "A", "C", "Up", "B", "Up", "B", "A," "Down" sul primo controller di giocatore. Viene visualizzata la finestra di un'opzione di "Trucchi" dove è possibile ascoltare suoni del gioco, Vedi Biografie dei personaggi e insieme il numero di continua in modalità arcade.
Menu segreti
Nel menu principale, premere "B", "A", "Down", "Sinistra", "A", "Down", "C", "destra", "Up", "Down" sul primo controller di giocatore. Verrà visualizzato un menu di "Segreti" che ti permette di visualizzare scena finale di qualsiasi carattere, modificare la velocità di conto alla rovescia del timer lotta e scegliere il livello che si desidera avviare da.
Livello segreto
Dopo aver sconfitto Shao Kahn in modalità arcade normale, viene visualizzato un messaggio che dice "Tu sei il nuovo campione di Mortal Kombat 3." Quando viene visualizzato questo messaggio, prendere il secondo controller lettore e premere "Start" per andare a una schermata di selezione del personaggio di due giocatori. Dopo che entrambi i giocatori scelgono un personaggio, la lotta si svolge al livello segreto. Il vincitore della partita sarà andare a faccia Shao Kahn nuovamente a meno che quel giocatore decide di terminare la partita con un montante.
Modalità Endurance
Evidenziare "Start Game" dal menu principale. Tenere premuto il "A," "B" e "C" e quindi premere "Start". Premere nuovamente "Start" per ottenere la schermata di selezione personaggio per modalità endurance. Utilizzare il pad direzionale per scegliere i caratteri che si desidera combattere in modalità endurance e premere "A" per aggiungerli a una delle caselle vuote. Si può scegliere un combattente casuale per una casella premendo il tasto "B", oppure scegliere tutti i combattenti casuali tenendo "Up" sul pad direzionale e premendo "Start".
Illimitato continua
Avviare un gioco single player e utilizzare il primo controller del giocatore. Se si perde una partita, immediatamente premere "Start" sul secondo controller lettore per iniziare una partita a due giocatori. Dopo si sconfiggere il tuo avversario statico nella partita di due giocatori, si continua dove si era interrotto nel vostro gioco giocatore singolo senza la necessità di utilizzare un continue.