Il numero di sostanze chimiche artificiali è aumentato drammaticamente nel corso dell'ultimo secolo. L'Università di Stirling, per esempio, stima che 100.000 composti chimici distinti sono commercializzati nella sola Unione europea. Molti di questi prodotti chimici trovare la loro strada nei sistemi di acqua. Anche se occorre ancora molta ricerca sui loro effetti, natura sta facendo alcuni dei danni evidenti.
Pesce
Passere con tumori e pinne sono stati scoperti in Nord America, il Regno Unito e nelle zone del mare del Nord dove c'è un'alta concentrazione di sostanze inquinanti. Ricerca si svolge generalmente in aree altamente problematiche, che lo rende difficile determinare le cause di specifici contaminanti. Secondo i ricercatori della Università di Stirling, "è stato difficile fornire l'evidenza che l'inquinamento è la causa di tali effetti negativi, o che è la causa di qualsiasi declini nei numeri della popolazione." Numeri della popolazione possono fluttuare per molte ragioni, molti di loro non necessariamente derivanti dall'inquinamento.
Proteine
Sostanze chimiche tossiche possono produrre proteine che imitano gli ormoni naturali. Misurare il livello di proteine animali acquatici offre la prova che i prodotti chimici tossici sono arrivati da luoghi come impianti di depurazione. Individuare la fonte diventa difficile se gli ambienti acquatici sono stati esposti per lungo tempo. I ricercatori da Stirling presentare sano annaspare nel 2009 a acqua proveniente da acqua contaminata nel Regno Unito. Hanno non trovato alcuna influenza sul trucco genetico del rombo dopo esposizione ad acqua contaminata. Tuttavia, i ricercatori hanno trovato il numero di geni del sistema immunitario incrementata.
Ossigeno
Vita acquatica ha bisogno di ossigeno per sopravvivere. Inquinanti come il letame e liquami aumentano il numero dei decompositori, che si sviluppano veloci e consumano grandi quantità di ossigeno. Pesci e piante muoiono quando loro ossigeno è esaurito, creando ulteriori decompositori e aggravando il problema. Fosfati e azoto sono anche inquinanti organici che danneggiano gli ambienti acquatici. Aumenta la crescita di piante e alghe, e la vegetazione ha bisogno di ossigeno, prendendolo dal pesce. Dopo queste piante muoiono, essi decadono e creare decompositori che consumano ossigeno; il ciclo continua.
Thermal
L'inquinamento termico può esaurire l'ossigeno nei corpi d'acqua. Ciò si verifica quando un'azienda usa l'acqua da una zona per raffreddare i suoi macchinari. Durante il processo di raffreddamento, l'acqua si riscalda e spesso viene restituito all'ambiente. Quando l'acqua viene riscaldata, perde ossigeno. Questa perdita limita la quantità disponibile per la vita acquatica. Piante e animali morirono di conseguenza.