Foratura avviene in ambienti fragili d'altura, interferire con i delicati ecosistemi di una moltitudine di organismi che si trovano in profondità all'interno di questi corpi idrici. Il risultato è di diversi tipi di inquinamento.
Sonic inquinamento
L'inquinamento acustico è una seria preoccupazione negli oceani. Mammiferi marini come balene e delfini utilizzano il suono per navigare, trovare cibo e la comunicano. Secondo il "New Scientist" rivista, sonic inquinamento degli oceani potrebbe causare questi animali alla spiaggia se stessi in spiaggiamenti di massa. Gli effetti sulle creature più piccole sono in gran parte sconosciuti. Foratura produce una percentuale significativa dell'inquinamento acustico sull'oceano.
Inquinamento da idrocarburi
Almeno 14.000 fuoriuscite di petrolio accade ogni anno, secondo l'US Environmental Protection Agency. Non potrebbe essere come ben pubblicizzati come la fuoriuscita di 2010 nel Golfo del Messico, ma i loro effetti sono gravi. L'olio è tossico. Sua inalazione, assorbimento e ingestione provoca problemi che vanno dalla morte immediata al fallimento a lungo termine per riprodurre in animali che vanno da larve di pesci balene, secondo l'Università della Florida.
Inquinamento di fango di perforazione
Fanghi contenenti prodotti chimici altamente tossici come piombo sono abitualmente utilizzati nella perforazione di un nuovo pozzo di perforazione. Poche centinaia di tonnellate di solito è scaricata per ogni nuovo pozzo, inquinando l'ambiente immediato e potenzialmente uccidere o danneggiare seriamente gli organismi locali.