Ecosistemi acquatici sono influenzati dal terreno adiacente. Ogni ecosistema supporta la propria comunità acquatica specializzata, che si sono adattate per la diversa composizione chimica di ciascuno di questi ecosistemi. La chimica dei sistemi fluviali come l'Amazzonia vengono modificati dal deflusso dalla foresta, mentre il litorale marino è influenzato in aree locali di acqua dolce che scorre in esso. La chimica degli estuari e costieri sale marche sono determinati dalla miscelazione di dolce e di mare acqua come fiumi raggiungono l'oceano.
Il pH, concentrazione
Il pH dell'acqua è una misura della sua acidità o alcalinità. Esso è rappresentato da una scala senza unità che vanno da 1.0, che è il più acidi tramite 7.0, che è neutro, a 14.0, che è il più alcalino. PH è quindi una misura della concentrazione di ioni idrogeno in un ecosistema. Esso fornisce un indicatore della relativa natura acida o alcalina di un campione. La scala del pH è logaritmica, che significa che ogni unità di pH rappresenta un cambiamento dieci volte nella concentrazione di ferro di idrogeno. Alcuni ecosistemi fluviali, come l'Amazzonia, hanno un pH acido, dovuto la grande quantità di vegetazione che si è lavata in acqua dalla giungla circostante. Altri sistemi di fiume hanno un pH neutro. La vita che ogni ecosistema supporta differisce a causa di specifiche chimica dell'acqua.
Alcalinità
L'alcalinità degli ecosistemi acquatici è determinato dal terreno e roccia fresca l'acqua scorre sopra. Alcalinità si riferisce alla capacità dell'acqua di resistere cali improvvisi o spostamenti del pH dell'acqua. Ciò si ottiene mediante composti di idrossido, carbonato e bicarbonato nell'acqua, che forniscono un buffer contro un calo del valore di pH. Borati e silicati promuoverà anche alcalinità, che è derivato dalle rocce e suolo nel letto del fiume. Acqua che scorre sopra calcare hanno una naturale elevata alcalinità, perché calcare contiene una notevole quantità di carbonati. Sistemi acquatici che scorrono sopra granito o pietra arenaria sarà basse alcalinità e l'acqua, sono definito "soft". Acqua con un'elevata alcalinità è conosciuto come "duro" e questi due sistemi supportano specie che si sono evoluti per prosperano solo in acqua soft o hard.
Biossido di carbonio
Anidride carbonica è presente nell'atmosfera, ma è anche in acqua. Rocce e sedimenti memorizzare biossido di carbonio in ecosistemi acquatici e questo prodotto, che è anche rilasciato attraverso il processo di disgregazione chimica o dissoluzione, è disponibile come entrambi bicarbonato o carbonato ioni nell'acqua. Vegetazione acquatica utilizzare anidride carbonica nel processo di fotosintesi, e la loro crescita è importante per molte specie acquatiche, basandosi sulle piante per il cibo.
Ossigeno
L'ossigeno è un fattore limitante negli ecosistemi acquatici. La quantità di ossigeno disciolto colpisce direttamente i vari organismi in un ecosistema acquatico. I livelli di ossigeno disciolto in questi sistemi sono influenzati da fattori quali la salinità, l'altitudine e la struttura di fiumi o ruscelli. I livelli in un sistema inversamente sono influenzati dalla temperatura, che influenza la quantità di ossigeno che può essere dissolto ossigeno disciolto.