In condizioni di stress ambientale, alcune specie di batteri producono endospore; endospores sono incapsulati pacchetti di materiale genetico non riproduttiva. Endospores permettere ai batteri di sopravvivere in condizioni che altrimenti disturberebbe i singoli-celled organismi. Le endospore di parola significa "seme interiore". Fedele al nome, forma endospore all'interno di batteri; fanno parte dell'organismo progenitore, però e semi non è veri. I batteri che producono endospore resistono a sforzi di sradicarli, rendendo particolarmente letali patogeni endospores---ad esempio i responsabili di botulismo e antrace--.
Approvvigionamento di generi alimentari insufficiente
Batteri che esauriscono la loro sostanza nutriente alimentazione endospores di forma per la carestia del tempo. Quando organismi ospite muoiono, forma endospore e incapsulano le informazioni genetiche essenziale all'interno di ogni batterio, permettendo così di diventare dormiente fino a quando il prossimo ospite ingerisce o lo inala. Altri batteri che producono endospore rimangono in questo stato sospeso di fuori di qualsiasi host. L'attacco di antrace posta a carico che ha ucciso cinque persone e più di una dozzina di altri disgustato nel 2001 conteneva endospores di anthracis Bacillus in forma di polvere bianca. Gli organismi non necessari nessun host nella loro fase producono endospore.
Radiazioni
Radiazione colpisce il materiale genetico nei batteri, così come avviene negli organismi più grandi e complessi. Sotto l'assalto di radiazione, i batteri che producono endospore incapsulano loro essenziali informazioni genetiche e la tempesta radioattiva. Irradiazione degli alimenti prontamente uccide i batteri che non possono formare endospores, ma non penetra il rivestimento di un'endospora per eseguire il rendering della cella non vitali. L'utilizzo di irradiazione come misura anti-microbica richiede più tempo e maggiore esposizione alla sorgente radioattiva a uccidere i endospores.
Calore
Trattamento termico denatura le proteine delle cellule; per le cellule batteriche non protette, alto calore uccide. Endospores può anche sopportare immersione in acqua bollente, che li rende difficili da sradicare durante la sterilizzazione di strumenti medici di laboratorio o di attrezzature. Elementi ben oltre il punto di ebollizione dell'acqua di riscaldamento in genere ucciderà endospores, ma bollente da solo potrebbe lasciare patogeni vitali dopo il tentativo di sterilizzazione. Ken Alibek, una presunta guerra batteriologica esperto, fatto il reclamo nel 2001 che stireria posta con ferro a vapore della famiglia sterilizzati qualsiasi contaminazione possibile antrace, ma come Bacillus anthracis sopravvive a temperature superiori a quelli di che una casa di ferro può produrre, questa affermazione era falsa.
Prodotti chimici
Candeggina, alcol e una miriade di altri disinfettanti sufficiente per uccidere la maggior parte dei batteri sulle superfici contaminate, ma endospores può resistere praticamente tutti i detergenti per la casa. Loro cappotto della proteina hardy, ma relativamente non reattivi, li protegge dagli effetti ossidanti delle soluzioni di candeggina debole. Disinfettanti che penetrano endospores e distruggere l'organismo dormiente che contengono sono essi stessi potenzialmente tossici, limitando la loro utilità.