Come calcolare le frequenze alleliche

Come calcolare le frequenze alleliche

I geni sono segmenti di DNA che codificano per le proteine, che sono molecole specializzate che eseguono una vasta gamma di attività in cellule. Se un gene è più di una variante, ogni variante è denominata un allele.

Gli organismi diploidi come gli esseri umani, che hanno due copie di ciascun gene, possono ereditare due alleli differenti, uno da ciascun genitore. Se i due alleli ereditati sono lo stesso, sono omozigoti; Se gli alleli sono diversi, sono eterozigoti.

La frazione del numero totale di alleli per un dato gene rappresenta la frequenza dell'allele per un allele specifico.

Istruzioni

• Determinare quanti alleli sono presenti nella popolazione per un dato gene. Se si sta conducendo il tuo esperimento, allora avrai bisogno di prendere un campione della popolazione e di identificare le varianti del gene presente in quel campione. Si tratta di una procedura complessa e oltre la portata di questo articolo.

Se stai lavorando questo problema su un test per una classe di genetica, la dimensione della popolazione e il numero di varianti del gene dovrebbe apparire nella questione.

• Determinare se il gene è legata al X. In esseri umani ed altri mammiferi, un maschio normale eredita solo una copia di un gene sul cromosoma X. Se stai lavorando su un problema di quiz, test o compiti di genetica, la domanda in generale indicherà se il gene per un tratto è legata al X. Se non è legata al X, è autosomica, il che significa che non è sui cromosomi sessuali.

• Scegliere una lettera o un simbolo per rappresentare ognuno degli alleli per un dato gene nei calcoli. Poiché ogni individuo ha due copie di un gene (a meno che non è legata al X), ogni individuo avrà due alleli.

Ad esempio, immaginiamo che abbiamo una popolazione di conigli in cui un singolo gene determina se i conigli hanno le orecchie pelosi o lisce. Questo gene ha due alleli: uno per le orecchie pelosi e uno per orecchie lisce. In questo caso, abbiamo potuto scegliere la lettera H per rappresentare questo gene; un capitale H rappresenterebbe l'allele pelosi-orecchio, e un minuscolo h rappresenterebbe l'allele liscio-orecchio.

In questo esempio, un coniglio individuo potrebbe ereditare un gene HH, un gene di Hh o un gene di hh.

• Annotare tutte le combinazioni possibili di allele del gene. Nell'esempio precedente, i conigli potrebbero avere le combinazioni HH, Hh o hh. Così, ci sono tre possibili combinazioni di alleli per un singolo coniglio. Se un coniglio ha due copie dello stesso allele (ad es., HH), è omozigote per quel gene. Se ha due alleli differenti (ad es., Hh), è eterozigote.

• Determinare quanti individui della popolazione sono omozigoti per un allele, e quanti sono eterozigoti. Nel nostro esempio di coniglio, diciamo che abbiamo 100 conigli: 50 di loro hanno HH, 30 hanno Hh e 20 hanno hh.

Supponendo che vogliamo trovare la frequenza dell'allele H, sarebbe notiamo che 50 conigli sono omozigotici per questo allele (HH), e 30 sono eterozigoti (Hh).

• Dividere il numero di omozigoti per il numero totale di individui della popolazione.

Dividere il numero degli eterozigoti per 2 e quindi dividere il risultato per il numero totale di individui della popolazione. Infine, aggiungere entrambi risultati per calcolare la frequenza dell'allele.

Nel nostro esempio di coniglio, avevamo 50 conigli con HH e 30 conigli con Hh, fuori 100 conigli totale. In primo luogo, dividiamo 50 per 100 e ottenere 0,5. Successivamente, dividiamo 30 da 2 e dividere il risultato---che è di 15---per 100, che ci dà 0,15. Infine, aggiungiamo 0,5 e 0,15 per ottenere 0,65.

Questa è la frequenza dell'allele per H; Essa ci dice quale frazione degli alleli nella popolazione coniglio sono H, al contrario di h.