L'Area sotto la malattia progresso curva (AUDPC) è una misura quantitativa dell'intensità della malattia con il tempo. Esso è usato in patologia vegetale per indicare e confrontare i livelli di resistenza a malattie tra varietà di piante. Il trapezio method.is il modo più comune per calcolare AUDPC. Viene eseguita utilizzando una formula ideata da Campbell e Madden nel 1990 o tracciando un grafico della percentuale di infezione contro il tempo e sommando i trapezi tra gli intervalli di tempo.
Istruzioni
Progressione di malattia di misura
• Ricerca regole e linee guida che si applicano alla misura specifica malattia e ritagliare indagano. La dimensione richiesta del campione pianta varia a seconda del raccolto e la malattia. Studiare la peronospora in tuberi, ad esempio, richiede un campione minimo di 40 piante.
• Il numero appropriato di impianti necessari per lo studio della pianta.
• Guarda attentamente per i segni della malattia. Ricerca quando segni dovrebbero verificarsi in modo che si sono preparati. Ad esempio, segni di peronospora si verificano circa 30-40 giorni dopo la semina e 10 giorni dopo l'ultima applicazione di fungicida.
• Visivamente una stima della percentuale di area fogliare infetti nel vostro campione, non appena si nota la malattia.
• Registrare la percentuale di area fogliare infetti a intervalli di tempo regolari. I ricercatori prendere lettura per peronospora ogni sette giorni se la malattia progredisce più rapidamente del previsto. Letture sono prese ogni 14 giorni quando è più lenta progressione della malattia.
• Interrompere la registrazione misure di infezione quando la percentuale di infezione si ferma in aumento e i livelli di progressione di malattia.
Calcolare AUDPC da un'equazione
• Aggiungere le percentuali di due infezione prime che è stata registrata.
• Dividere il risultato dell'addizione per due per trovare la media o medio-valore delle due letture.
• Moltiplicare la media o medio-valore per l'intervallo di tempo, che è il numero di giorni dalla prima lettura per la seconda lettura. Se hai preso la prima il giorno 20 e la seconda lettura il giorno 27, per esempio, quindi il numero di giorni, o intervallo di tempo, è sette giorni.
• Registrare il risultato in unità di percentuale giorni. Il valore è un'area di un trapezio.
• Ripetere i passaggi uno a quattro per le letture di infezione secondo e il terzo che hai preso. Il loro risultato sarà l'area di un trapezio secondo. Ripetere passaggi uno a quattro finché non avete calcolato del trapezio aree per tutte le letture.
• Aggiungere tutti i trapezi per trovare il AUDPC. AUDPCs inferiore rappresentano più lenta progressione di malattia e una maggiore resistenza alla malattia. AUDPCs superiore rappresentano più veloce progressione della malattia e una maggiore suscettibilità alla malattia.
Consigli & Avvertenze
- AUDPC inoltre è trovato tracciando la percentuale di infezione contro il tempo su un grafico. L'area di ogni trapezio tra le letture viene calcolato utilizzando la geometria semplice.
- AUDPC consente intervalli di tempo tra letture di variare, ma letture dovrebbero iniziare subito dopo ha inizio la malattia. Un lungo ritardo si traduce in materiali sensibili non facenti parte della curva di progresso di malattia.
- Per la stima coinvolta nella valutazione della percentuale di infezione, AUDPC è considerata una variabile pseudo-quantitativa. Il AUDPC è solo una stima dell'area sotto la curva di infezione reale.
- Il AUDPC non è generalmente paragonabile attraverso esperimenti a causa di vari fattori come la presenza di condizioni patologiche avverse o favorevoli.